I sintomi della peste bubbonica compaiono solitamente da 2 a 5 giorni dopo l'esposizione ai batteri, ma possono manifestarsi da poche ore a 12 giorni dopo. Cominciano bruscamente con brividi e febbre fino a 41 ° C. I battiti del cuore diventano veloci e deboli e la pressione sanguigna può cadere. L'ano appare allo stesso tempo o subito dopo la febbre e di solito è doloroso alla palpazione.
La piaga causata dall'infezione da Yersinia pestis può essere pestis bubbonica, polmonare, setticemica o minore ei sintomi variano a seconda del tipo di peste. Ci possono essere irrequietezza, delirio, confusione mentale e perdita di coordinazione motoria. Il fegato e la milza possono aumentare di volume.
Più della metà degli individui non trattati muore tra il terzo e il quinto giorno dopo l'insorgenza dei sintomi.